隨著資訊技術的進步與普及，資料的收集變得容易且快速，在健康照護領域也同樣累積的大量的資料，加上政府大力推廣電子病歷相關技術與應用，電子病歷日漸普及，然而電子病歷的相關應用服務仍有進步的空間。健康照護資料除了電子病歷之外，還有其他參考價值極高的資料，可以進一步整合，整合後的大量資料需要有效率的資訊檢索與儲存方式，才能進行有效率的擷取與分析，發展各種加值應用。
健康資料的加值應用往往令人擔憂如何合宜的保護個人隱私，過去有許多隱私強化技術的研究成果，目前的挑戰在於如何達到既可以滿足研究需求又同時可以尊重個人意願與保護個人隱私。
資料科學應可對醫療照護有很大的幫助，隨著學習型健康照護系統的推進，資料科學將對醫學知識的發現累積與傳播產生革命性的影響。健康雲計畫資訊子計畫研究最適宜的健康資訊檢索和儲存技術，選用最合適的資安與隱私保護與強化技術，建構以尊重自主與保護隱私為基礎的資料整合與擷取平台，同時研究分析健康資料的新方法與資料視覺化的工具，新的計算模式的建立除了可以協助生醫公衛等領域的專家進行研究，除了提供臨床治療建議之外，也可進一步衍生出智慧醫療應用以及增進學習型健康照護系統的發展。